Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hmgn5Q9JL35 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hmgn5Q9JL35 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hmgn5Q9JL35 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hmgn5Q9JL35 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hmgn5Q9JL35 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hmgn5Q9JL35 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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