Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms