Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms