Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Wdr61Q9ERF3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms