Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vmn1r56Q9EPS9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vmn1r56Q9EPS9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vmn1r56Q9EPS9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vmn1r56Q9EPS9 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vmn1r56Q9EPS9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vmn1r56Q9EPS9 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vmn1r56Q9EPS9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vmn1r56Q9EPS9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vmn1r56Q9EPS9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vmn1r56Q9EPS9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vmn1r56Q9EPS9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vmn1r56Q9EPS9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r56Q9EPS9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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