Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 9330159N22Rik-201ENSMUST00000221530 1031 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Pilrb2-201ENSMUST00000164886 1807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm7942-201ENSMUST00000163216 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm44951-201ENSMUST00000206449 2024 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Myhas-201ENSMUST00000137662 787 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm6578-202ENSMUST00000203684 560 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 AC183268.3-201ENSMUST00000215015 282 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Aldh8a1-201ENSMUST00000042699 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms