Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Smg9Q9DB90 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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