Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4bQ9D8B3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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