Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms