Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc130Q9D516 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms