Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D2Q3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms