Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PmpcbQ9CXT8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms