Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc2Q9CX47 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms