Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms