Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms