Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Use1Q9CQ56 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Use1Q9CQ56 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Use1Q9CQ56 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Use1Q9CQ56 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Use1Q9CQ56 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Use1Q9CQ56 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Use1Q9CQ56 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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