Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Chmp3Q9CQ10 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Chmp3Q9CQ10 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Chmp3Q9CQ10 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
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Chmp3Q9CQ10 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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