Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms