Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Brms1Q99N20 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Brms1Q99N20 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Brms1Q99N20 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Brms1Q99N20 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Brms1Q99N20 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Brms1Q99N20 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Brms1Q99N20 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Brms1Q99N20 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Brms1Q99N20 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms