Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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