Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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TrabdQ99JY4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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TrabdQ99JY4 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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TrabdQ99JY4 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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TrabdQ99JY4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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TrabdQ99JY4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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