Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pacsin3Q99JB8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pacsin3Q99JB8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms