Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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