Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Vmn1r200Q8R281 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vmn1r200Q8R281 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vmn1r200Q8R281 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vmn1r200Q8R281 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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