Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rnf183Q8QZS5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms