Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ssh3Q8K330 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ssh3Q8K330 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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