Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn34c1Q8K193 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms