Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Col6a6Q8C6K9 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Col6a6Q8C6K9 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Col6a6Q8C6K9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Col6a6Q8C6K9 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Col6a6Q8C6K9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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