Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssuh2Q8C3L1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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