Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Rbbp5Q8BX09 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Rbbp5Q8BX09 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp5Q8BX09 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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