Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms