Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Lrrtm2Q8BGA3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Lrrtm2Q8BGA3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Lrrtm2Q8BGA3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Lrrtm2Q8BGA3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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