Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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