Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg2bQ80XK6 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms