Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms