Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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