Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms