Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ckap2lQ7TS74 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms