Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms