Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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