Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf1Q6PDM2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms