Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms