Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zbtb40Q6PCS8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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