Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CltbQ6IRU5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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