Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Msl2Q69ZF8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms