Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtmQ62388 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms