Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Taf6Q62311 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Taf6Q62311 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Taf6Q62311 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Taf6Q62311 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Taf6Q62311 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
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Taf6Q62311 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
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Taf6Q62311 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Taf6Q62311 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms