Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms