Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atf3Q60765 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Atf3Q60765 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf3Q60765 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Atf3Q60765 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Atf3Q60765 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Atf3Q60765 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms