Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms